巖石通常由兩種或更多種的內部的礦物質組成
微生物的棲息地——巖石圈
巖石和礦石
要了解巖石圈是怎樣使微生物在它們的內部和表面生長，以及微生
物又給巖石和礦石的結構和轉化產生了怎樣的影響，我們要對巖石和礦
石的化學和物理特性做一個大概的了解。
從地質學的角度來講，巖石是指大量無機的固體物質，通常是由兩
種或更多種的內部的礦物質組成。在起源上，巖石是熱成的，也就是說
它可能是由來源于地球(地殼和／或巖流圈)內部的巖漿(溶化的巖石物)
冷卻形成的。冷卻過程可能是慢速的也可能是快速的。在慢速冷卻過程
中，不同的物質由于它們有不同的溶點，因此會在不同的時刻才開始結
晶。在結晶過程中，它們開始融合并因此以可見晶體溶進巖石，例如我
們常見的花崗巖。在快速冷卻過程中，快速結晶也就產生了，而且巖石
中含有的那些細小晶體是肉眼不可見的，玄武巖就是以這種方式生成的
一個例子
花崗巖顯示的斑晶，在一個完整的水晶中，有肉眼可見的礦物質晶
體，上面的碎塊有5cm長；(B)取自夏威夷Kilauea的繩狀玄武巖，深色
的點和小洞是由于
融化的巖漿在凝固時由于外部的氣體而造成的，沒有可見的斑晶(B
)
在起源上，巖石還可能是沉淀形成的。它們是通過沉淀物的積累和
緊壓生成的，而且這些沉淀物主要由來源于其他巖石的礦物質組成。換
句話說，巖石的出現是由于積累的無機沉淀物的粘固，而這些沉淀物是
由碳酸鹽、硅酸鹽、氧化鋁、氧化鐵其中的一種或多種組成。這些物質
的黏固可能來源于微生物活性物質。這些松散的沉淀變為沉淀巖石，我
們稱之為巖化。例如沉積巖石像石灰石、砂巖和頁巖的形成。
